Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smarcad1Q04692 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms