Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Runx1Q03347 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Runx1Q03347 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms