Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnb1Q02248 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnb1Q02248 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms