Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Uba1Q02053 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uba1Q02053 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms