Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms