Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sec23aQ01405 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms