Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Top2aQ01320 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Top2aQ01320 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms