Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EgfrQ01279 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EgfrQ01279 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms