Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pde1bQ01065 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde1bQ01065 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms