Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbp1Q00915 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms