Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smyd1P97443 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smyd1P97443 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms