Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lig3P97386 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms