Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PrkdcP97313 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PrkdcP97313 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms