Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim43bP86448 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms