Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp8a1P70704 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atp8a1P70704 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms