Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cxcr4P70658 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcr4P70658 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cxcr4P70658 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcr4P70658 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcr4P70658 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cxcr4P70658 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms