Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tp53bp1P70399 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tp53bp1P70399 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms