Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfi1P70338 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gfi1P70338 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms