Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb13P70321 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb13P70321 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb13P70321 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb13P70321 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms