Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cux2P70298 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cux2P70298 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cux2P70298 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms