Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SbdsP70122 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SbdsP70122 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms