Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pcsk1P63239 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk1P63239 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1P63239 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1P63239 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk1P63239 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1P63239 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1P63239 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk1P63239 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk1P63239 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms