Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabrb3P63080 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms