Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl39P62892 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms