Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl18aP62717 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms