Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SnrpfP62307 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms