Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2fP61219 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms