Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdrg1P59048 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms