Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rhbdl3P58873 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms