Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp5P56399 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms