Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ephb3P54754 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ephb3P54754 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms