Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Map3k1P53349 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Map3k1P53349 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms