Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClgnP52194 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClgnP52194 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms