Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxc13P50207 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms