Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms