Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrprbP47758 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms