Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sipa1P46062 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms