Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ItgavP43406 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ItgavP43406 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms