Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vps26aP40336 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms