Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms