Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fen1P39749 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms