Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf2P39429 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf2P39429 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms