Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc11P31313 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms