Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms