Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa2P28309 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms