Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtmaP26350 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms