Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PparaP23204 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PparaP23204 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PparaP23204 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PparaP23204 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms