Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F3P20352 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F3P20352 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F3P20352 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F3P20352 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
F3P20352 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F3P20352 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F3P20352 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms