Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pou5f1P20263 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms