Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P20040 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P20040 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P20040 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P20040 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P20040 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms